8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132377
Cell Name :  170221_12_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-vGut2a
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  midbrain tegmentum
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  170221_12_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  2069.86 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  42
Number of Branches :  85
Overall Width :  115.45 μm
Overall Height :  421.02 μm
Overall Depth :  175.58 μm
Average Diameter :  3.29 μm
Total Length :  2896.02 μm
Total Surface :  30683.5 μm2
Total Volume :  27465.8 μm3
Max Euclidean Distance :  327.69 μm
Max Path Distance :  725.95 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1414
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  2.26
Average Bifurcation Angle Local :  71.25°
Average Bifurcation Angle Remote :  67.68°
Fractal Dimension :  1.04

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