8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132373
Cell Name :  170221_11_2
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-vGut2a
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  170221_11_2.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  3327.06 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  46
Number of Branches :  94
Overall Width :  93.91 μm
Overall Height :  159.69 μm
Overall Depth :  198.69 μm
Average Diameter :  4.58 μm
Total Length :  1513.68 μm
Total Surface :  24037.4 μm2
Total Volume :  35709.8 μm3
Max Euclidean Distance :  167.07 μm
Max Path Distance :  582.76 μm
Max Branch Order :  26
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  553
Partition Asymmetry :  0.73
Average Rall's Ratio :  2.08
Average Bifurcation Angle Local :  98.85°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.85°
Fractal Dimension :  1.04

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