8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_275611
Cell Name :  1638_S4_L5_fitvolume-000
Archive Name :  Ciganok-Huckels_Jehasse_Kampa
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  26.0 days
Max Age :  26.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-08-29
Date of Upload :  2024-02-15
Persistence Vector :  1638_S4_L5_fitvolume-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Postnatal development of electrophysiological and morphological properties in layer 2/3 and layer 5 pyramidal neurons in the mouse primary visual cortex.

Measurements
Soma Surface :  2015.73 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  67
Number of Branches :  142
Overall Width :  397.75 μm
Overall Height :  667.69 μm
Overall Depth :  47.85 μm
Average Diameter :  3.93 μm
Total Length :  7568.09 μm
Total Surface :  101464 μm2
Total Volume :  203244 μm3
Max Euclidean Distance :  549.97 μm
Max Path Distance :  863.75 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.77
Total Fragmentation :  5147
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  9.23
Average Bifurcation Angle Local :  82.01°
Average Bifurcation Angle Remote :  72.07°
Fractal Dimension :  1.08

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