8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_275650
Cell Name :  1638_S3_L2_fitvolume-000
Archive Name :  Ciganok-Huckels_Jehasse_Kampa
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  26.0 days
Max Age :  26.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-08-29
Date of Upload :  2024-02-15
Persistence Vector :  1638_S3_L2_fitvolume-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Postnatal development of electrophysiological and morphological properties in layer 2/3 and layer 5 pyramidal neurons in the mouse primary visual cortex.

Measurements
Soma Surface :  446.27 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  41
Number of Branches :  89
Overall Width :  239.08 μm
Overall Height :  287.29 μm
Overall Depth :  50.25 μm
Average Diameter :  2.48 μm
Total Length :  3662.31 μm
Total Surface :  26394.3 μm2
Total Volume :  20607.4 μm3
Max Euclidean Distance :  254.71 μm
Max Path Distance :  325.19 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  2793
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  2.4
Average Bifurcation Angle Local :  84.15°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.62°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website