8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_195572
Cell Name :  16280-011
Archive Name :  Luo
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP-M
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Excitatory, corticofugal
Original Format :  GTree.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  GTree
Date of Deposition :  2020-05-29
Date of Upload :  2022-08-29
Persistence Vector :  16280-011.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Pinpointing Morphology and Projection of Excitatory Neurons in Mouse Visual Cortex.

Measurements
Soma Surface :  109.45 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  48
Overall Width :  1955.04 μm
Overall Height :  1535.6 μm
Overall Depth :  2108.25 μm
Average Diameter :  0.53 μm
Total Length :  7260.98 μm
Total Surface :  12167.4 μm2
Total Volume :  1622.53 μm3
Max Euclidean Distance :  3173.42 μm
Max Path Distance :  4062.03 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  1617
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  72.66°
Average Bifurcation Angle Remote :  65.29°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website