8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132927
Cell Name :  161031_15_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  left
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  161031_15_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1188.42 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  8
Number of Branches :  21
Overall Width :  16.24 μm
Overall Height :  80.99 μm
Overall Depth :  21.02 μm
Average Diameter :  3.4 μm
Total Length :  224.98 μm
Total Surface :  2541.47 μm2
Total Volume :  2479.52 μm3
Max Euclidean Distance :  80.34 μm
Max Path Distance :  114.56 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  98
Partition Asymmetry :  0.7
Average Rall's Ratio :  2.05
Average Bifurcation Angle Local :  88.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.28°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website