8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133159
Cell Name :  161026_HuCxBG_erksyp_22_2
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  pretectal region, left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  161026_HuCxBG_erksyp_22_2.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1301.47 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  91
Overall Width :  93.59 μm
Overall Height :  341.67 μm
Overall Depth :  150.43 μm
Average Diameter :  3.25 μm
Total Length :  1578.83 μm
Total Surface :  16290 μm2
Total Volume :  14245.7 μm3
Max Euclidean Distance :  340.19 μm
Max Path Distance :  831.58 μm
Max Branch Order :  27
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  848
Partition Asymmetry :  0.75
Average Rall's Ratio :  2.07
Average Bifurcation Angle Local :  104.21°
Average Bifurcation Angle Remote :  91.53°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website