8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132956
Cell Name :  161026_HuCxBG_erksyp_18_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  midbrain tegmentum
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  161026_HuCxBG_erksyp_18_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1382.91 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  2
Number of Branches :  9
Overall Width :  25.85 μm
Overall Height :  178.67 μm
Overall Depth :  92.43 μm
Average Diameter :  3.98 μm
Total Length :  354.54 μm
Total Surface :  4610.42 μm2
Total Volume :  5151.92 μm3
Max Euclidean Distance :  186.6 μm
Max Path Distance :  307.64 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  157
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2.32
Average Bifurcation Angle Local :  136.39°
Average Bifurcation Angle Remote :  103.72°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website