8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141356
Cell Name :  161004_Trace4
Archive Name :  Epsztein
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  25.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  66 grams
Max Weight :  159 grams
Development :  young
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Theta-burst stimulation (TBS)
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-09-11
Date of Upload :  2020-10-12
Persistence Vector :  161004_Trace4.pvec
Note :  Each TBS series consisted of 10 EPSC-like waveforms delivered at 100 Hz, repeated 10x at 5 Hz.

Reference Article
Related Article Reference :  Kv1.1 contributes to a rapid homeostatic plasticity of intrinsic excitability in CA1 pyramidal neurons in vivo.

Measurements
Soma Surface :  733.43 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  95
Number of Branches :  198
Overall Width :  235.74 μm
Overall Height :  594.78 μm
Overall Depth :  282.77 μm
Average Diameter :  1.26 μm
Total Length :  11260.8 μm
Total Surface :  47977.1 μm2
Total Volume :  19568.2 μm3
Max Euclidean Distance :  497.59 μm
Max Path Distance :  628.82 μm
Max Branch Order :  36
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  3446
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  1.54
Average Bifurcation Angle Local :  64.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.3°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website