8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133318
Cell Name :  160927_HuCxBG_Erk_5_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160927_HuCxBG_Erk_5_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  795.56 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  64
Number of Branches :  129
Overall Width :  113.19 μm
Overall Height :  413.63 μm
Overall Depth :  89.25 μm
Average Diameter :  3.16 μm
Total Length :  2252.41 μm
Total Surface :  22945.6 μm2
Total Volume :  19904.9 μm3
Max Euclidean Distance :  443.42 μm
Max Path Distance :  620.73 μm
Max Branch Order :  20
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  952
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  2.23
Average Bifurcation Angle Local :  80.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  70.63°
Fractal Dimension :  1.05

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