8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133446
Cell Name :  160927_HuCxBG_Erk_15_3
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160927_HuCxBG_Erk_15_3.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1132.2 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  4
Number of Branches :  11
Overall Width :  48.25 μm
Overall Height :  286.93 μm
Overall Depth :  67.86 μm
Average Diameter :  3.44 μm
Total Length :  504.14 μm
Total Surface :  5728.38 μm2
Total Volume :  5599.42 μm3
Max Euclidean Distance :  300.47 μm
Max Path Distance :  376.26 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  187
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2.17
Average Bifurcation Angle Local :  75.38°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.87°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website