8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133189
Cell Name :  160906_9_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  hindbrain
Tertiary Brain Region :  reticular formation, right, posterior, right, posterior
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160906_9_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1294.74 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  38
Overall Width :  27.59 μm
Overall Height :  91.72 μm
Overall Depth :  165.11 μm
Average Diameter :  3.72 μm
Total Length :  758.91 μm
Total Surface :  9327.31 μm2
Total Volume :  9946.79 μm3
Max Euclidean Distance :  126.56 μm
Max Path Distance :  249.06 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  363
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2.39
Average Bifurcation Angle Local :  73.04°
Average Bifurcation Angle Remote :  89.74°
Fractal Dimension :  1.05

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