8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133345
Cell Name :  160906_5_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160906_5_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  2579.7 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  116
Number of Branches :  233
Overall Width :  93.28 μm
Overall Height :  145.96 μm
Overall Depth :  114.33 μm
Average Diameter :  3.9 μm
Total Length :  3113.14 μm
Total Surface :  39636.8 μm2
Total Volume :  44457.7 μm3
Max Euclidean Distance :  184.29 μm
Max Path Distance :  467.23 μm
Max Branch Order :  18
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1240
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  2.69
Average Bifurcation Angle Local :  86.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.47°
Fractal Dimension :  1.06

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