8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132324
Cell Name :  160812_6_2
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160812_6_2.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1673.02 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  92
Overall Width :  68.21 μm
Overall Height :  411.68 μm
Overall Depth :  145.24 μm
Average Diameter :  3.54 μm
Total Length :  1584.06 μm
Total Surface :  18171.8 μm2
Total Volume :  17964.1 μm3
Max Euclidean Distance :  412.75 μm
Max Path Distance :  670.68 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  655
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2.31
Average Bifurcation Angle Local :  80.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  80.96°
Fractal Dimension :  1.07

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