8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133825
Cell Name :  160809_1_5
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  myelencephalon
Secondary Brain Region :  left
Tertiary Brain Region :  stripe 1
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160809_1_5.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1005.07 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  84
Overall Width :  40.18 μm
Overall Height :  149.69 μm
Overall Depth :  88.05 μm
Average Diameter :  3.44 μm
Total Length :  754.93 μm
Total Surface :  8496.36 μm2
Total Volume :  8264 μm3
Max Euclidean Distance :  166.94 μm
Max Path Distance :  286.27 μm
Max Branch Order :  18
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  260
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  3.17
Average Bifurcation Angle Local :  76.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.03°
Fractal Dimension :  1.06

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