8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133963
Cell Name :  160809_18_3
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  hypothalamus
Secondary Brain Region :  intermediate zone
Tertiary Brain Region :  right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160809_18_3.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1292.22 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  42
Number of Branches :  86
Overall Width :  64.95 μm
Overall Height :  175.47 μm
Overall Depth :  97.54 μm
Average Diameter :  3.97 μm
Total Length :  1315.08 μm
Total Surface :  17422.1 μm2
Total Volume :  20322.3 μm3
Max Euclidean Distance :  157.9 μm
Max Path Distance :  340.11 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  566
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2.58
Average Bifurcation Angle Local :  91.17°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.15°
Fractal Dimension :  1.05

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