8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133704
Cell Name :  160714_8_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  optic lobe
Secondary Brain Region :  medulla
Tertiary Brain Region :  Left Medulla
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160714_8_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1271.76 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  32
Number of Branches :  65
Overall Width :  36.08 μm
Overall Height :  264.69 μm
Overall Depth :  94.19 μm
Average Diameter :  3.53 μm
Total Length :  1053.42 μm
Total Surface :  12104.8 μm2
Total Volume :  11806.1 μm3
Max Euclidean Distance :  251.94 μm
Max Path Distance :  460.67 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  418
Partition Asymmetry :  0.73
Average Rall's Ratio :  2.47
Average Bifurcation Angle Local :  91.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.42°
Fractal Dimension :  1.04

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