8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132937
Cell Name :  160607_16_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  midbrain tegmentum
Tertiary Brain Region :  right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160607_16_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1519.17 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  4
Overall Width :  34.59 μm
Overall Height :  169.33 μm
Overall Depth :  111.57 μm
Average Diameter :  4.26 μm
Total Length :  364.36 μm
Total Surface :  5286.21 μm2
Total Volume :  6750.87 μm3
Max Euclidean Distance :  176.82 μm
Max Path Distance :  325.52 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.78
Total Fragmentation :  148
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  2.13
Average Bifurcation Angle Local :  50.47°
Average Bifurcation Angle Remote :  19.61°
Fractal Dimension :  1.06

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