8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132848
Cell Name :  160524_3_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  myelencephalon
Secondary Brain Region :  dorsal motor nucleus of the vagus
Tertiary Brain Region :  right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160524_3_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1183.11 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  25
Overall Width :  42.68 μm
Overall Height :  264.64 μm
Overall Depth :  56.44 μm
Average Diameter :  4.45 μm
Total Length :  546.9 μm
Total Surface :  8224.48 μm2
Total Volume :  10696.2 μm3
Max Euclidean Distance :  276.36 μm
Max Path Distance :  383.22 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  164
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2.32
Average Bifurcation Angle Local :  90.79°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.58°
Fractal Dimension :  1.03

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