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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_134523
Cell Name :  160502_5_3
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  160502_5_3.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  3368.54 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  13
Overall Width :  26.3 μm
Overall Height :  219.76 μm
Overall Depth :  97.77 μm
Average Diameter :  5.42 μm
Total Length :  424.65 μm
Total Surface :  8315.01 μm2
Total Volume :  15008.2 μm3
Max Euclidean Distance :  212.84 μm
Max Path Distance :  338.69 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  204
Partition Asymmetry :  0.27
Average Rall's Ratio :  1.82
Average Bifurcation Angle Local :  102°
Average Bifurcation Angle Remote :  112.26°
Fractal Dimension :  1.06

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