8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78173
Cell Name :  160412001pairb-1
Archive Name :  Pal
Species Name :  mouse
Strain :  GFAP-tdtomato
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  16.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  pedunculopontine nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-08-07
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  160412001pairb-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Astrocyte-Dependent Slow Inward Currents (SICs) Participate in Neuromodulatory Mechanisms in the Pedunculopontine Nucleus (PPN).

Measurements
Soma Surface :  1812.37 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  29
Overall Width :  263.39 μm
Overall Height :  432.29 μm
Overall Depth :  37.17 μm
Average Diameter :  0.8 μm
Total Length :  2131.78 μm
Total Surface :  5229.78 μm2
Total Volume :  1123.42 μm3
Max Euclidean Distance :  321.77 μm
Max Path Distance :  441.58 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  555
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  1.57
Average Bifurcation Angle Local :  85.67°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.86°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website