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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132916
Cell Name :  1600520_8_2
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  thalamus
Secondary Brain Region :  left
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  1600520_8_2.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1567.77 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  40
Overall Width :  33.25 μm
Overall Height :  332.55 μm
Overall Depth :  88.42 μm
Average Diameter :  3.21 μm
Total Length :  751.72 μm
Total Surface :  7768.11 μm2
Total Volume :  7098.74 μm3
Max Euclidean Distance :  346.16 μm
Max Path Distance :  444.48 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  322
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.26
Average Bifurcation Angle Local :  60.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.37°
Fractal Dimension :  1.04

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