8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_275665
Cell Name :  1580_S3_L2_fitvolume-000
Archive Name :  Ciganok-Huckels_Jehasse_Kampa
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  27.0 days
Max Age :  27.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-08-29
Date of Upload :  2024-02-15
Persistence Vector :  1580_S3_L2_fitvolume-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Postnatal development of electrophysiological and morphological properties in layer 2/3 and layer 5 pyramidal neurons in the mouse primary visual cortex.

Measurements
Soma Surface :  888.66 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  55
Number of Branches :  120
Overall Width :  131.79 μm
Overall Height :  319.49 μm
Overall Depth :  52 μm
Average Diameter :  3 μm
Total Length :  4862.53 μm
Total Surface :  45883.1 μm2
Total Volume :  60023.4 μm3
Max Euclidean Distance :  271.92 μm
Max Path Distance :  394.61 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.72
Total Fragmentation :  2958
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  3.56
Average Bifurcation Angle Local :  92.05°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.97°
Fractal Dimension :  1.1

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