8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_93808
Cell Name :  15121c4_Geoff_Basket
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Htr3a-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  45.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  basket
Tertiary Cell Class :  Cholecystokinin (CCK)-positive
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2018-01-09
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  15121c4_Geoff_Basket.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Persistent inhibitory circuit defects and disrupted social behaviour following in utero exogenous cannabinoid exposure.

Measurements
Soma Surface :  7734.08 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  30
Overall Width :  233.63 μm
Overall Height :  481.48 μm
Overall Depth :  12.99 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2654.2 μm
Total Surface :  2084.58 μm2
Total Volume :  130.28 μm3
Max Euclidean Distance :  320.36 μm
Max Path Distance :  368.17 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  7058
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  43.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  49.66°
Fractal Dimension :  1.04

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website