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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_93809
Cell Name :  15119c1_Geoff_Basket
Archive Name :  McBain
Species Name :  mouse
Strain :  Htr3a-GFP
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  45.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  basket
Tertiary Cell Class :  Cholecystokinin (CCK)-positive
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  in utero exogenous cannabinoid exposure
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2018-01-09
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  15119c1_Geoff_Basket.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Persistent inhibitory circuit defects and disrupted social behaviour following in utero exogenous cannabinoid exposure.

Measurements
Soma Surface :  3438.63 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  23
Overall Width :  229.26 μm
Overall Height :  422.49 μm
Overall Depth :  17.27 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  2244.3 μm
Total Surface :  1762.67 μm2
Total Volume :  110.17 μm3
Max Euclidean Distance :  240.93 μm
Max Path Distance :  355.36 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  6073
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  32.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.65°
Fractal Dimension :  1.04

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