8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_134540
Cell Name :  151113_3_2
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  151113_3_2.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1281.42 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  5
Overall Width :  14.09 μm
Overall Height :  152.92 μm
Overall Depth :  44.01 μm
Average Diameter :  3.41 μm
Total Length :  225.98 μm
Total Surface :  2510.14 μm2
Total Volume :  2364.79 μm3
Max Euclidean Distance :  152.46 μm
Max Path Distance :  196.82 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  113
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  1.77
Average Bifurcation Angle Local :  53.82°
Average Bifurcation Angle Remote :  55.39°
Fractal Dimension :  1.11

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website