8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141439
Cell Name :  150924_p06_s2_1_s_scaled
Archive Name :  Johenning
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  olfactory cortex
Secondary Brain Region :  piriform
Tertiary Brain Region :  anterior, layer 2a
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  semilunar cell
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-08-24
Date of Upload :  2020-10-13
Persistence Vector :  150924_p06_s2_1_s_scaled.pvec
Note :  In the Morphology File (Original), the apical tree has layer-specific tags in the second SWC field: 4 for layer 2, 5 for layer 1b, and 6 for layer 1a

Reference Article
Related Article Reference :  Circuit-Specific Dendritic Development in the Piriform Cortex.

Measurements
Soma Surface :  390.87 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  30
Number of Branches :  66
Overall Width :  72.89 μm
Overall Height :  126.17 μm
Overall Depth :  32.45 μm
Average Diameter :  1.78 μm
Total Length :  1146.6 μm
Total Surface :  6511.07 μm2
Total Volume :  3084.79 μm3
Max Euclidean Distance :  109.52 μm
Max Path Distance :  114.64 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  311
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.8
Average Bifurcation Angle Local :  50.6°
Average Bifurcation Angle Remote :  49.67°
Fractal Dimension :  1.02

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