8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132812
Cell Name :  150910_1_1_full_tracing
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1101tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  brainstem
Secondary Brain Region :  hindbrain
Tertiary Brain Region :  reticular formation, right, anterior, right, anterior
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  150910_1_1_full_tracing.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  188.67 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  9
Number of Branches :  20
Overall Width :  19.06 μm
Overall Height :  191.54 μm
Overall Depth :  40.56 μm
Average Diameter :  2.41 μm
Total Length :  343.59 μm
Total Surface :  2606.14 μm2
Total Volume :  1645.78 μm3
Max Euclidean Distance :  173.79 μm
Max Path Distance :  211.75 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  83
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  2.09
Average Bifurcation Angle Local :  66.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.88°
Fractal Dimension :  1.03

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