8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141423
Cell Name :  150827_p13_s1_s1_s_scaled
Archive Name :  Johenning
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  13.0 days
Max Age :  13.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  olfactory cortex
Secondary Brain Region :  piriform
Tertiary Brain Region :  anterior, layer 2a
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  semilunar cell
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-08-24
Date of Upload :  2020-10-13
Persistence Vector :  150827_p13_s1_s1_s_scaled.pvec
Note :  In the Morphology File (Original), the apical tree has layer-specific tags in the second SWC field: 4 for layer 2, 5 for layer 1b, and 6 for layer 1a

Reference Article
Related Article Reference :  Circuit-Specific Dendritic Development in the Piriform Cortex.

Measurements
Soma Surface :  578.77 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  34
Number of Branches :  73
Overall Width :  201.13 μm
Overall Height :  361.42 μm
Overall Depth :  44.9 μm
Average Diameter :  1.79 μm
Total Length :  2887.13 μm
Total Surface :  16262.3 μm2
Total Volume :  7638.79 μm3
Max Euclidean Distance :  306.23 μm
Max Path Distance :  327.51 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  746
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.79
Average Bifurcation Angle Local :  49.16°
Average Bifurcation Angle Remote :  53.1°
Fractal Dimension :  1.03

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