8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132630
Cell Name :  150827_1_1a
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1101tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  150827_1_1a.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  261.62 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  37
Overall Width :  15.45 μm
Overall Height :  49.62 μm
Overall Depth :  85.61 μm
Average Diameter :  3.56 μm
Total Length :  525.87 μm
Total Surface :  6109.22 μm2
Total Volume :  6212.95 μm3
Max Euclidean Distance :  79.61 μm
Max Path Distance :  163.12 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  89
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  2.68
Average Bifurcation Angle Local :  101.06°
Average Bifurcation Angle Remote :  94.64°
Fractal Dimension :  1.07

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website