8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141393
Cell Name :  150813_p06_s1_s1_s_scaled
Archive Name :  Johenning
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  olfactory cortex
Secondary Brain Region :  piriform
Tertiary Brain Region :  anterior, layer 2a
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  semilunar cell
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-08-24
Date of Upload :  2020-10-13
Persistence Vector :  150813_p06_s1_s1_s_scaled.pvec
Note :  In the Morphology File (Original), the apical tree has layer-specific tags in the second SWC field: 4 for layer 2, 5 for layer 1b, and 6 for layer 1a

Reference Article
Related Article Reference :  Circuit-Specific Dendritic Development in the Piriform Cortex.

Measurements
Soma Surface :  82.96 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  34
Number of Branches :  74
Overall Width :  93.46 μm
Overall Height :  180.9 μm
Overall Depth :  59.37 μm
Average Diameter :  1.59 μm
Total Length :  1434.24 μm
Total Surface :  7409.87 μm2
Total Volume :  3370.56 μm3
Max Euclidean Distance :  152.07 μm
Max Path Distance :  164.09 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  503
Partition Asymmetry :  0.57
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  67.05°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.58°
Fractal Dimension :  1.05

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