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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132554
Cell Name :  150707_13_1_full
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1101tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  midbrain tegmentum
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  150707_13_1_full.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  149.82 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  29
Overall Width :  13.79 μm
Overall Height :  68.42 μm
Overall Depth :  26.5 μm
Average Diameter :  3.2 μm
Total Length :  308.76 μm
Total Surface :  3243.46 μm2
Total Volume :  2989.15 μm3
Max Euclidean Distance :  71.89 μm
Max Path Distance :  116.32 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  66
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  3.34
Average Bifurcation Angle Local :  87.87°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.67°
Fractal Dimension :  1.12

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