8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_134583
Cell Name :  150616_fixed_354_6_1_full_tracing
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Not reported
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  150616_fixed_354_6_1_full_tracing.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  174.78 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  1
Number of Branches :  4
Overall Width :  3.79 μm
Overall Height :  75.21 μm
Overall Depth :  17.88 μm
Average Diameter :  2.77 μm
Total Length :  106.36 μm
Total Surface :  933.48 μm2
Total Volume :  694.89 μm3
Max Euclidean Distance :  79.64 μm
Max Path Distance :  88.15 μm
Max Branch Order :  1
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  23
Partition Asymmetry :  0
Average Rall's Ratio :  1.54
Average Bifurcation Angle Local :  129.46°
Average Bifurcation Angle Remote :  123.29°
Fractal Dimension :  1.02

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