8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132565
Cell Name :  150518_3_3_full_tracing
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-s1101tET
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  150518_3_3_full_tracing.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  211.01 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  21
Number of Branches :  43
Overall Width :  27.03 μm
Overall Height :  81.02 μm
Overall Depth :  35.04 μm
Average Diameter :  2.98 μm
Total Length :  391.48 μm
Total Surface :  3690.36 μm2
Total Volume :  2937.75 μm3
Max Euclidean Distance :  89.48 μm
Max Path Distance :  114.59 μm
Max Branch Order :  10
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  113
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  2.87
Average Bifurcation Angle Local :  91.89°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.16°
Fractal Dimension :  1.03

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