8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141380
Cell Name :  150311_p13_s3_d4_d_scaled
Archive Name :  Johenning
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6N
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  13.0 days
Max Age :  13.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  olfactory cortex
Secondary Brain Region :  piriform
Tertiary Brain Region :  anterior, layer 2b
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  400  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2020-08-24
Date of Upload :  2020-10-13
Persistence Vector :  150311_p13_s3_d4_d_scaled.pvec
Note :  In the Morphology File (Original), the apical tree has layer-specific tags in the second SWC field: 4 for layer 2, 5 for layer 1b, and 6 for layer 1a

Reference Article
Related Article Reference :  Circuit-Specific Dendritic Development in the Piriform Cortex.

Measurements
Soma Surface :  1524.9 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  44
Number of Branches :  97
Overall Width :  173.97 μm
Overall Height :  452.48 μm
Overall Depth :  26.98 μm
Average Diameter :  3.18 μm
Total Length :  5268.43 μm
Total Surface :  53497.3 μm2
Total Volume :  45119.9 μm3
Max Euclidean Distance :  291.61 μm
Max Path Distance :  369.77 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  1484
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  2.15
Average Bifurcation Angle Local :  58.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  51.58°
Fractal Dimension :  1.07

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