8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_52814
Cell Name :  150113CA1cell-4
Archive Name :  Imai
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  48.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  220  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-17
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  150113CA1cell-4.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Super-Resolution Mapping of Neuronal Circuitry With an Index-Optimized Clearing Agent.

Measurements
Soma Surface :  417.27 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  15
Number of Branches :  35
Overall Width :  47.94 μm
Overall Height :  77.18 μm
Overall Depth :  58.01 μm
Average Diameter :  0.62 μm
Total Length :  709.9 μm
Total Surface :  1527.95 μm2
Total Volume :  382.06 μm3
Max Euclidean Distance :  87.57 μm
Max Path Distance :  104.36 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  1117
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.85
Average Bifurcation Angle Local :  49.16°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.02°
Fractal Dimension :  1.05

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