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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_52811
Cell Name :  150113CA1cell-1
Archive Name :  Imai
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  48.0 days
Max Age :  56.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  220  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2016-01-17
Date of Upload :  2017-03-30
Persistence Vector :  150113CA1cell-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Super-Resolution Mapping of Neuronal Circuitry With an Index-Optimized Clearing Agent.

Measurements
Soma Surface :  377.55 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  50
Overall Width :  154.71 μm
Overall Height :  118.94 μm
Overall Depth :  87.7 μm
Average Diameter :  0.57 μm
Total Length :  1588.33 μm
Total Surface :  3235.05 μm2
Total Volume :  821.04 μm3
Max Euclidean Distance :  157.64 μm
Max Path Distance :  189.96 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  2449
Partition Asymmetry :  0.31
Average Rall's Ratio :  1.76
Average Bifurcation Angle Local :  38.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  46.97°
Fractal Dimension :  1.03

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