8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_242818
Cell Name :  15-3-2021-se2-gfp-positive-po2-Merged_Data
Archive Name :  Achim_Partanen
Species Name :  mouse
Strain :  Skor2-GFP/+
Structural Domains :  Neurites, No Soma
Physical Integrity :  Neurites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  7.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  reticular formation
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  GABAergic
Tertiary Cell Class :  Skor2-positive, adapting
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  250  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2022-09-28
Date of Upload :  2022-10-12
Persistence Vector :  15-3-2021-se2-gfp-positive-po2-Merged_Data.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Gata2, Nkx2-2 and Skor2 form a transcription factor network regulating development of a midbrain GABAergic neuron subtype with characteristics of REM-sleep regulatory neurons.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  11
Overall Width :  234.15 μm
Overall Height :  73.28 μm
Overall Depth :  37.42 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  695.37 μm
Total Surface :  546.14 μm2
Total Volume :  34.13 μm3
Max Euclidean Distance :  202.93 μm
Max Path Distance :  251.52 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  1205
Partition Asymmetry :  0.8
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  124.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  123.64°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website