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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_141463
Cell Name :  1450-6c-1
Archive Name :  Cai
Species Name :  mouse
Strain :  POMC-Cre +/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.5 months
Max Age :  1.5 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  dentate gyrus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  granule
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  nTracer.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Brainbow
Slicing Direction :  Sagittal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  nTracer
Date of Deposition :  2019-05-28
Date of Upload :  2020-10-14
Persistence Vector :  1450-6c-1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Multispectral tracing in densely labeled mouse brain with nTracer.

Measurements
Soma Surface :  75.95 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  14
Overall Width :  41.86 μm
Overall Height :  78.26 μm
Overall Depth :  139.93 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  821.08 μm
Total Surface :  644.88 μm2
Total Volume :  40.3 μm3
Max Euclidean Distance :  169.54 μm
Max Path Distance :  523.49 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.63
Total Fragmentation :  1552
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  116.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  119.65°
Fractal Dimension :  1.25

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