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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_67050
Cell Name :  140227-5-12wk-9
Archive Name :  Ohgomori
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  spinal cord
Secondary Brain Region :  lumbar
Tertiary Brain Region :  ventral horn
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  mSOD1 mutant
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-30
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  140227-5-12wk-9.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Comparative morphometric analysis of microglia in the spinal cord of SOD1(G93A) transgenic mouse model of amyotrophic lateral sclerosis.

Measurements
Soma Surface :  293.89 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  49
Overall Width :  15.8 μm
Overall Height :  46.55 μm
Overall Depth :  40.95 μm
Average Diameter :  0.48 μm
Total Length :  356.93 μm
Total Surface :  546.54 μm2
Total Volume :  72.63 μm3
Max Euclidean Distance :  38.92 μm
Max Path Distance :  57.06 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  282
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.55
Average Bifurcation Angle Local :  87.98°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.7°
Fractal Dimension :  1.06

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