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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66857
Cell Name :  140220-2-IDPN1-6
Archive Name :  Ohgomori
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  5.2 months
Gender :  Female
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  spinal cord
Secondary Brain Region :  lumbar
Tertiary Brain Region :  ventral horn
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  IDPN treated
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  50  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-30
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  140220-2-IDPN1-6.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Comparative morphometric analysis of microglia in the spinal cord of SOD1(G93A) transgenic mouse model of amyotrophic lateral sclerosis.

Measurements
Soma Surface :  86.65 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  30
Overall Width :  41.4 μm
Overall Height :  16 μm
Overall Depth :  35.6 μm
Average Diameter :  0.51 μm
Total Length :  270.85 μm
Total Surface :  453.95 μm2
Total Volume :  70.05 μm3
Max Euclidean Distance :  29.13 μm
Max Path Distance :  61.34 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  149
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  1.56
Average Bifurcation Angle Local :  78.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.11°
Fractal Dimension :  1.1

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