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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35974
Cell Name :  13i-Jun15-IR1-1-b
Archive Name :  Luebke
Species Name :  mouse
Strain :  FVB/129
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  13.0 months
Max Age :  13.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  old
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  frontal
Tertiary Brain Region :  layer 3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Biocytin, Streptavidin-Alexa 546
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-08-19
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  13i-Jun15-IR1-1-b.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Electrophysiological changes precede morphological changes to frontal cortical pyramidal neurons in the rTg4510 mouse model of progressive tauopathy.

Measurements
Soma Surface :  1296.94 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  60
Number of Branches :  125
Overall Width :  252.52 μm
Overall Height :  393.25 μm
Overall Depth :  146.75 μm
Average Diameter :  0.08 μm
Total Length :  6399.58 μm
Total Surface :  1608.39 μm2
Total Volume :  32.17 μm3
Max Euclidean Distance :  301.36 μm
Max Path Distance :  365.04 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  5912
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  62.66°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.32°
Fractal Dimension :  1.03

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