8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_36040
Cell Name :  130312-MV-3f
Archive Name :  Margrie
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.2 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  21 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 6
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  corticocortical, Regular spiking
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  enhanced green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-01-16
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  130312-MV-3f.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The stimulus selectivity and connectivity of layer six principal cells reveals cortical microcircuits underlying visual processing.

Measurements
Soma Surface :  374.58 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  118
Number of Branches :  243
Overall Width :  1327.83 μm
Overall Height :  485.48 μm
Overall Depth :  326.05 μm
Average Diameter :  0.07 μm
Total Length :  25932.5 μm
Total Surface :  5702.85 μm2
Total Volume :  99.8 μm3
Max Euclidean Distance :  1118.96 μm
Max Path Distance :  2829.09 μm
Max Branch Order :  28
Average Contraction :  0.8
Total Fragmentation :  20164
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  92.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  92.9°
Fractal Dimension :  1.03

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