8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_49497
Cell Name :  13-1-JB
Archive Name :  Smith
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  43.0 days
Max Age :  43.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  ventral striatum
Tertiary Brain Region :  nucleus accumbens, shell
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  medium spiny
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Early withdrawal: 1 day post saline/saline
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-05-12
Date of Upload :  2016-09-01
Persistence Vector :  13-1-JB.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Adolescent nicotine-induced dendrite remodeling in the nucleus accumbens is rapid, persistent, and D1-dopamine receptor dependent.

Measurements
Soma Surface :  532.97 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  43
Overall Width :  295.17 μm
Overall Height :  345.41 μm
Overall Depth :  90.75 μm
Average Diameter :  1.14 μm
Total Length :  3272.59 μm
Total Surface :  11797.7 μm2
Total Volume :  3660.8 μm3
Max Euclidean Distance :  298.49 μm
Max Path Distance :  345.99 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  3960
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.68
Average Bifurcation Angle Local :  79.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  62.72°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website