8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_117420
Cell Name :  12_46
Archive Name :  Banerjee
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuronstudio.swc
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Ineffective RNAi
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronStudio
Date of Deposition :  2019-06-10
Date of Upload :  2019-12-13
Persistence Vector :  12_46.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Modulation of hippocampal synapse maturation by activity-regulated E3 ligase via non-canonical pathway.

Measurements
Soma Surface :  997.26 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  55
Number of Branches :  113
Overall Width :  47.57 μm
Overall Height :  103.12 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.26 μm
Total Length :  623.17 μm
Total Surface :  2171.83 μm2
Total Volume :  2981.89 μm3
Max Euclidean Distance :  108.72 μm
Max Path Distance :  119.14 μm
Max Branch Order :  21
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  2408
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  6.07
Average Bifurcation Angle Local :  83.58°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.84°
Fractal Dimension :  1.16

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