8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_131320
Cell Name :  12A3neuron2
Archive Name :  Ellender
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  35.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Spiny, apical intermediate progenitor (aIP)-derived
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in utero
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2020-04-14
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  12A3neuron2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Embryonic progenitor pools generate diversity in fine-scale excitatory cortical subnetworks.

Measurements
Soma Surface :  780.76 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  14
Overall Width :  68 μm
Overall Height :  164.45 μm
Overall Depth :  94.38 μm
Average Diameter :  0.55 μm
Total Length :  758.52 μm
Total Surface :  1310.63 μm2
Total Volume :  180.21 μm3
Max Euclidean Distance :  130.13 μm
Max Path Distance :  171.38 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  693
Partition Asymmetry :  0.2
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  110.29°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.15°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website