8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_127558
Cell Name :  12-4_16
Archive Name :  La Barbera
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  4.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Resolvin D1
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2019-11-12
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  12-4_16.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Blunting neuroinflammation with resolvin D1 prevents early pathology in a rat model of Parkinson's disease.

Measurements
Soma Surface :  222.65 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  32
Overall Width :  45.81 μm
Overall Height :  30.53 μm
Overall Depth :  0.87 μm
Average Diameter :  0.08 μm
Total Length :  198.87 μm
Total Surface :  49.98 μm2
Total Volume :  1 μm3
Max Euclidean Distance :  27.88 μm
Max Path Distance :  38.01 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  516
Partition Asymmetry :  0.35
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  94.04°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.43°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website