8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107668
Cell Name :  12-0-21-0-50
Archive Name :  Chadderton
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.5 months
Gender :  Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  mesencephalon
Secondary Brain Region :  tectum
Tertiary Brain Region :  inferior colliculus, Dorsal cortex
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2018-11-22
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  12-0-21-0-50.pvec
Note :  Cells were labeled by viral transfection using post-mGRASP (AAV-CAG-post-mGRASP-2A-dTomato)

Reference Article
Related Article Reference :  Combining mGRASP and Optogenetics Enables High-Resolution Functional Mapping of Descending Cortical Projections.

Measurements
Soma Surface :  537.87 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  21
Overall Width :  100.62 μm
Overall Height :  194.5 μm
Overall Depth :  35.61 μm
Average Diameter :  1.12 μm
Total Length :  863.84 μm
Total Surface :  3283.38 μm2
Total Volume :  1103.9 μm3
Max Euclidean Distance :  142.56 μm
Max Path Distance :  161.98 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  560
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  1.5
Average Bifurcation Angle Local :  74.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.48°
Fractal Dimension :  1.03

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