8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_277068
Cell Name :  114F_section2_image1_RFPneuron4_trace
Archive Name :  Schaaf_Zarbalis
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6NJ
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  8.0 days
Max Age :  30.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.traces
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  td Tomato fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  10x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-12-04
Date of Upload :  2024-03-07
Persistence Vector :  114F_section2_image1_RFPneuron4_trace.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  WDFY3 mutation alters laminar position and morphology of cortical neurons.

Measurements
Soma Surface :  554.3 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  13
Number of Branches :  34
Overall Width :  91.5 μm
Overall Height :  226.11 μm
Overall Depth :  0.56 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  904.91 μm
Total Surface :  2842.86 μm2
Total Volume :  710.71 μm3
Max Euclidean Distance :  171.34 μm
Max Path Distance :  200.35 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1180
Partition Asymmetry :  0.62
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  28.22°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.52°
Fractal Dimension :  1.04

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