8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_84694
Cell Name :  1108642
Archive Name :  Jekely
Species Name :  Clam worm
Strain :  Platynereis dumerilii
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 days
Max Age :  3.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  peptidergic circuit
Secondary Brain Region :  nuchal organs
Tertiary Brain Region :  left
Primary Cell Class :  sensory
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Catmaid.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunogold
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  0.05  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  electron microscopy
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  Catmaid
Date of Deposition :  2017-06-30
Date of Upload :  2018-04-16
Persistence Vector :  1108642.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  A serial multiplex immunogold labeling method for identifying peptidergic neurons in connectomes.

Measurements
Soma Surface :  64.75 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  30
Number of Branches :  62
Overall Width :  27.99 μm
Overall Height :  18.94 μm
Overall Depth :  46.02 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  170.02 μm
Total Surface :  267.06 μm2
Total Volume :  33.38 μm3
Max Euclidean Distance :  43.31 μm
Max Path Distance :  81.84 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.81
Total Fragmentation :  1138
Partition Asymmetry :  0.78
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  111.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  110.99°
Fractal Dimension :  1.17

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website